Уголовное дело в отношении высокопоставленного чиновника было возбуждено 28 апреля 2006 года. Как установило следствие, будучи председателем жилищной комиссии Администрации Президента и Правительства Бурятии, он нарушил порядок выделения безвозмездных субсидий на приобретение жилья за счет средств республиканского бюджета.
Не относясь к категории граждан, нуждающихся в улучшении жилищных условий, Иннокентий Дагбаев приобрел 4-комнатную квартиру стоимостью около 1,5 млн. рублей и оформил в свою собственность.
Следствие и судебная тяжба длились почти 2 года. В итоге гособвинитель потребовал приговорить бывшего главу администрации президента к 5 годам лишения свободы условно, а также лишить его права занимать государственные должности сроком на 3 года.
Однако суд, учитывая ряд смягчающих обстоятельств, приговорил его к 3 годам лишения свободы условно. Сторона обвинения считает приговор слишком мягким и намерено его обжаловать. Между тем сам Иннокентий Дагбаев свою вину так и не признал.